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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  26 lines
  1. ************************************************
  2. * Seminal vesicle protein II repeats signature *
  3. ************************************************
  4.  
  5. Seminal vesicle  protein II (SVP-II) [1] is  one  of  the six  major secretory
  6. proteins secreted by rat seminal vesicle. It is a clotting protein that serves
  7. as the substrate in the  formation of the copulatory plug.  Covalent  clotting
  8. of this protein is catalyzed by a transglutaminase and involves  the formation
  9. of gamma-glutamyl-epsilon-lysine crosslinks. SVS-II sequence contains thirteen
  10. repeats of a thirteen amino acid  residue domain which is probably involved in
  11. the cross-linking.  There  are a  number of invariant residues in this domain,
  12. four of them  (two lysines and two glutamines)  probably  participate  in  the
  13. cross-links.  The pattern we have developed comprises positions 2 to 12 of the
  14. domain and includes the four putative cross-linking residues.
  15.  
  16. -Consensus pattern: [GSA]-Q-x-K-S-[FY]-x-Q-x-K-[SA]
  17.                     [Q's and K's are probably involved in cross-links]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL; it will
  19.  detect 12 of the 13 occurrences of the repeat.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21. -Last update: December 1991 / First entry.
  22.  
  23. [ 1] Harris S.E., Harris M.A., Johnson C.M., Bean M.F., Dodd J.G.,
  24.      Matusik R.J., Carr S.A., Crabb J.W.
  25.      J. Biol. Chem. 265:9896-9903(1990).
  26.